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在競(jìng)爭(zhēng)激烈的基因測(cè)序領(lǐng)域,一塊巴掌大的不銹鋼適配器正悄然改變著DNA樣本前處理的游戲規(guī)則。上海凈信的JXDNA-500PICO高通量聲波基因組剪切儀,讓實(shí)驗(yàn)研究人員告別了通宵達(dá)旦的樣本處理。

在基因組學(xué)研究與臨床診斷領(lǐng)域,高質(zhì)量的DNA片段化是測(cè)序成功的基石。上海凈信推出的JXDNA-500PICO高通量聲波基因組剪切儀,通過(guò)精準(zhǔn)溫控與多頻自適應(yīng)技術(shù)的創(chuàng)新結(jié)合,為這一實(shí)驗(yàn)難題提供了突破性的解決方案。
技術(shù)瓶頸:DNA片段化的質(zhì)量挑戰(zhàn)
在高通量測(cè)序樣本制備過(guò)程中,DNA片段化處理是一個(gè)核心環(huán)節(jié)。DNA文庫(kù)的質(zhì)量和均一性程度都依賴(lài)于這一步。
1.隨機(jī)性:獲取全基因組覆蓋的保證;2.準(zhǔn)確性:測(cè)序質(zhì)量和效率的關(guān)鍵;3.集中無(wú)偏差:提高測(cè)序深度的關(guān)鍵,這三個(gè)特征的實(shí)現(xiàn)是保證日常測(cè)序工作順利進(jìn)行的必要條件。
傳統(tǒng)超聲破碎方法存在明顯局限:交叉污染風(fēng)險(xiǎn)、樣本損耗大、重復(fù)性差,以及對(duì)于珍貴樣本而言難以承受的成本壓力。這些問(wèn)題在臨床診斷和科研研究中尤為突出。例如,在液體活檢中,腫瘤來(lái)源的循環(huán)DNA往往呈現(xiàn)更短的片段長(zhǎng)度,需要精細(xì)的片段化技術(shù)才能準(zhǔn)確捕捉這些信息。
技術(shù)創(chuàng)新:精準(zhǔn)控溫與多頻自適應(yīng)的協(xié)同效應(yīng)
高通量聲波基因組剪切儀JXDNA-500PICO的創(chuàng)新核心在于將精準(zhǔn)溫控與多頻自適應(yīng)技術(shù)融為一體。設(shè)備采用4℃低溫水浴超聲波技術(shù),能量分布均勻,超聲作用好。樣品在低溫環(huán)境中進(jìn)行,有效避免了樣品的變性。這種精密溫控對(duì)于保持DNA樣本活性至關(guān)重要,尤其是對(duì)溫度敏感的臨床樣本。
多頻自適應(yīng)技術(shù)則通過(guò)三組原裝ibidi多頻超聲換能器實(shí)現(xiàn)。多種超聲頻率同時(shí)工作,能量輸出均衡,超聲密度均一。這種非接觸的處理方式確保了實(shí)驗(yàn)效果一致性好。
效能提升:從單一樣本到高通量處理的跨越
高通量超聲波基因組剪切儀JXDNA-500PICO在高通量處理方面表現(xiàn)出色。設(shè)備配備多種適配器,可同時(shí)處理30個(gè)0.1ml樣本,或20個(gè)0.65ml樣本,或11個(gè)2ml樣本。這種靈活配置使實(shí)驗(yàn)室能夠根據(jù)樣本量靈活選擇處理模式,大幅提升工作效率。
根據(jù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,該儀器對(duì)200ng全血DNA樣本的片段化效果優(yōu)異,通過(guò)Qsep100片段分析儀檢測(cè),打斷的DNA片段在200-400bp區(qū)間占比達(dá)47.7%-49.2%片段平均值集中在283.7bp-290.3bp之間,峰形單一且完整,符合高質(zhì)量文庫(kù)構(gòu)建要求。
與需要特殊耗材的傳統(tǒng)設(shè)備不同,JXDNA-500PICO適用于常規(guī)0.1ml至50ml離心管,不需使用特殊材質(zhì)(如玻璃)的耗材,顯著節(jié)省實(shí)驗(yàn)成本。
應(yīng)用場(chǎng)景:從基礎(chǔ)科研到臨床診斷的廣泛適用
實(shí)驗(yàn)設(shè)備在多種應(yīng)用場(chǎng)景中展現(xiàn)了其出色性能。在細(xì)菌細(xì)胞破碎、蛋白質(zhì)抽提方面,其非接觸式處理有效避免了樣本交叉污染。在免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)、霉菌孢子破碎中,其低溫控制特性保證了生物分子的完整性。
在二代測(cè)序樣本DNA片段化這一核心應(yīng)用上,儀器表現(xiàn)出顯著優(yōu)勢(shì)。隨著cfDNA片段組學(xué)在癌癥檢測(cè)中顯示革命性潛力。對(duì)DNA片段化技術(shù)的要求日益提高——需要更精準(zhǔn)地控制片段長(zhǎng)度,以識(shí)別腫瘤來(lái)源的特異性片段特征。腫瘤來(lái)源的cfDNA往往呈現(xiàn)更短的片段長(zhǎng)度(約143bp),而JXDNA-500PICO的精確片段化能力為此類(lèi)研究提供了理想的技術(shù)支持。
此外,高通量超聲波基因組剪切儀JXDNA-500PICO在用戶體驗(yàn)方面進(jìn)行了細(xì)致優(yōu)化。設(shè)備采用7寸醫(yī)用級(jí)電阻觸摸屏,實(shí)時(shí)顯示工作參數(shù)時(shí)間、溫度、功率及運(yùn)行模式。儀器的智能旋轉(zhuǎn)系統(tǒng)超聲時(shí)自動(dòng)連續(xù)旋轉(zhuǎn)離心管適配器,使超聲能量分布更均勻,確保樣本效果一致。
綜上,隨著對(duì)基因測(cè)序質(zhì)量的要求不斷提升。上海凈信高通量超聲波基因組剪切儀JXDNA-500PICO通過(guò)精準(zhǔn)溫控與多頻自適應(yīng)技術(shù)的創(chuàng)新結(jié)合,為DNA片段化設(shè)立了新標(biāo)準(zhǔn)。其超聲設(shè)備的應(yīng)用價(jià)值不僅在于提升當(dāng)前實(shí)驗(yàn)效率,更在于為科研研究提供了可靠的技術(shù)支撐。